Если организация оплачивает обучение детей своих сотрудников, данную сумму не нужно облагать НДФЛ. Так как в пункте 21 статьи 217 НК РФ четко говорится, что суммы платы за обучение налогоплательщика по основным и дополнительным общеобразовательным и профессиональным образовательным программам освобождаются от НДФЛ. Единственное условие: наличие лицензии (для российских образовательных учреждений) или соответствующего статуса (для иностранных образовательных учреждений).
При этом тот факт, что налогоплательщик является сотрудником организации, в данном случае не имеет значения (письмо Минфина России от 04.10.12 № 03-04-06/6-295).

Пресс-служба ИФНС России
 по г. Сургуту ХМАО-Югры